
AMD EPYC Rome の性能検証その3(Amber18)
今回ベンチマークを行うアプリケーションはAmberです。
Amberは生体分子シミュレーション用アプリケーションです。(公式HP)
Amber は 有償のSolverと無償のツール群(AmberTools)に分かれており、
SolverのビルドにはAmberToolsのビルドも必要になります。
2020年2月17日時点での最新版は、Amber(Solver)がVersion 18 、
AmberTools が Version 19となります。
前回のHPLと同様に、Compiler、数値演算ライブラリ、MPIを変化させてベンチマークを取得していきたいと考えていたのですが...
...