計算化学 ソフトウェア

■ 量子化学

• Gaussian

  Gaussian社開発のデファクト・
  スタンダード量子化学計算プログラム

  Gaussianは量子化学計算のデファクト・スタンダードといわれる、米Gaussian社の電子構造モデリングの先端技術を持った量子化学計算プログラムです。実...

  http://www.gaussian.com/

  https://www.hpc.co.jp/chem/software/gaussian/

  

• Reaction plus Pro 2 / Express 2

  ONIOM法を用いた酵素反応等、
  Reaction plusではできなかった
  様々な反応系の計算が可能に

  これまで反応経路を求めるには経験と勘が必要とされ、特に肝となる遷移状態(TS)構造の最適化には大変な苦労を強いられることが常でした。また、せっかくTSが求ま... https://www.hpc.co.jp/chem/software/react2/

  

• GRRM-Basic

  たった１つの分子をインプットするだけで
  すべての反応経路を自動探索

  たった１つの分子をインプットするだけで、そこから生成されうるすべての生成物やそれを生成しうるすべての反応物、そしてそれらすべての反応経路を自動的に探索できる... https://www.hpc.co.jp/chem/software/grrm-basic/

  

• GaussView

  Gaussian専用の可視化ソフトウェア

  GaussViewは量子化学計算ソフトウェアGaussian専用の可視化ソフトウェアです。分子のモデリング、Gaussianによる量子化学計算の実行、分子軌...

  http://gaussian.com/gaussview6/

  https://www.hpc.co.jp/chem/software/gaussview/

  

• NWChem

  大規模計算化学の問題を効率的に扱う
  オープンソース計算化学プログラム
  

  NWChemは大規模計算化学の問題を効率的に扱うオープンソース計算化学プログラムです。化学的変換の力学、界面や凝縮相の化学の研究を行うために、米パシフィック...

  http://www.nwchem-sw.org/index.php/Main_Page

  https://www.hpc.co.jp/chem/software/nwchem/

• GAMESS

  無償提供の原子、分子の非経験的分子軌道法・
  密度汎関数理論計算プログラム

  GAMESSはGaussianと並び広く利用されている、Hartree-Fock(HF)近似を基礎とした原子・分子の非経験的分子軌道法(MO法)・密度汎関数...

  http://www.msg.chem.iastate.edu/gamess/index.html

  https://www.hpc.co.jp/chem/software/gamess/

• QMMM plus 2

  QM/MM法による溶媒効果を自動計算

  化学計算ソフトウェアで有名なAMBER、GROMACS、Gaussian に誰もが簡単に使えるよう機能をプラス！
  シミュレーションが手軽にでき... https://www.hpc.co.jp/chem/software/plus_qmp2/

  

■ 分子動力学

• LAMMPS

  古典分子動力学計算の
  オープンソース分子動力学計算プログラム

  LAMMPSは米エネルギー省サンディア国立研究所のS. Plimptonらのグループにより開発された古典分子動力学(MD)計算プログラムです。...

  http://lammps.sandia.gov/

  https://www.hpc.co.jp/chem/software/lammps/

  

• Gromacs

  地球最速のオープンソース
  分子動力学計算プログラム

  GROMACSはオランダ・フローニンゲン大学で開発され、現在はスウェーデン・王立工科大学とウプサラ大学のGROMACS開発チームにより開発されている分子動力...

  http://www.gromacs.org/

  https://www.hpc.co.jp/chem/software/gromacs/

  

• Amber

  生体分子系のシミュレーションのための
  プログラム群

  Amberは米カリフォルニア大学のP. A. Kollmanらのグループにより開発された、生体分子の分子動力学(MD)計算のための力場群であり、またこれらの...

  http://ambermd.org/

  https://www.hpc.co.jp/chem/software/amber/

  

• 力場最適化ソフトウェア Simple Fit（仮称）

  分子動力学計算(MD)の精度を決める
  力場最適化ソフトウェア

  分子動力学計算(MD)の精度の要は力場パラメータ。しかし、力場パラメータの作成は極めて大変なため、力場パラメータの自作はあきらめ、論文から力場パラメータを探... https://www.hpc.co.jp/chem/software/simplefit/

  

■ 固体物理

• VASP

  ウィーン大学の
  固体電子状態計算・バンド計算プログラム

  VASPはオーストリア・ウィーン大学で開発された、擬ポテンシャルと平面波基底を用いた非経験的(ab initio)量子分子動力学(MD)計算プログラムです。...

  https://www.vasp.at/

  https://www.hpc.co.jp/chem/software/vasp/

• Quantum ESPRESSO (PWscf)

  密度汎関数法に基づく
  電子状態計算プログラム

  Quantum ESPRESSOは伊ICTPおよびQuantum ESPRESSO Foundationにより開発・維持している密度汎関数理論(DFT)、平...

  http://www.quantum-espresso.org/

  https://www.hpc.co.jp/chem/software/quantumespresso/

■ 旧製品

• Reaction plus Pro

  反応物と生成物自動探索が
  Reaction plusに比べ大幅にスピードアップ

  これまで反応経路を求めるには経験と勘が必要とされ、特に肝となる遷移状態(TS)構造の最適化には大変な苦労を強いられることが常でした。また、せっかくTSが求ま... https://www.hpc.co.jp/chem/software/react1/

  

• Reaction plus Express

  反応経路をたった数分で予測するソフトウェア

  Reaction plus Expressは反応経路をたった数分で予測するソフトウェアです。DFTの代わりに半経験的手法を採用し、さらに独自の改良を加えるこ... https://www.hpc.co.jp/chem/software/reactx/

  

• Reaction plus

  反応物と生成物を指定するだけで
  自動的に反応経路を探索

  これまで反応経路を求めるには勘と経験が必要とされ、特に肝となる遷移状態(TS)構造の最適化には大変な苦労を強いられることが常でした。また、せっかくTSが求ま... https://www.hpc.co.jp/chem/software/react1n/

  

• QM plus

  量子化学ソフトウェアで有名なGaussianに
  便利な機能をプラス！

  本ソフトウェアはQMMM plusの機能のうち量子化学計算機能だけに限定した機能限定版となります。特徴についてはQMMM plusを参照ください。... https://www.hpc.co.jp/chem/software/plus_gau2/

  

• GaussRun

  計算機サーバのGaussianを簡単操作

  GaussRunはクリックでLinux版のGaussianが操作できます。これが意外と便利！ 普段WindowsやMacしか使わないユーザだけでなく、Lin... https://www.hpc.co.jp/chem/software/gaussrun/

  

• Solution plus for GROMACS

  Solution plus for GROMACS

  分子動力学ソフトウェアで有名なGROMACS に誰もが簡単に使えるよう機能をプラス！
  シミュレーションが手軽にできるようになります。... https://www.hpc.co.jp/chem/software/plus_gmx2/

  

• Solution plus for AMBER

  分子動力学ソフトウェアで有名なAMBERに
  誰もが簡単に使えるよう機能をプラス

  分子動力学ソフトウェアで有名なAMBER に誰もが簡単に使えるよう機能をプラス！
  シミュレーションが手軽にできるようになります。... https://www.hpc.co.jp/chem/software/plus_amb2/