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HPCシステムズのエンジニア達による技術ブログ

Tech Blog

GRRM

計算化学

弊社主催GRRM/GRRMmapチュートリアルセミナー

こんにちは!HPC事業部 技術グループのnabeoです。 弊社のメールニュースを受信いただいている方には3/12に募集開始のメールが届いていると思います。受信していなかった...!! という方のために、こちらの Tech Blog でもご紹介いたします。GRRM経験10年以上の弊社技術員によるGRRMとGRRMmapのセミナーです。お申込みをお待ちしております! セミナー概要 名称:GRRM/GRRMmapチュートリアルセミナー 主催:HPCシステムズ株式会社 GRRMの基本的な使い方を座学および実習形式で学べます。GRRMユーザーはもちろん、これからGRRM導入をご検討中の方も大歓...
計算化学

GRRMでxTBを使ってみる

こんにちは!HPC事業部の技術グループのnabeoです。 半経験的タイトバインディングのソフトウェア xTB は、軽量な量子化学計算エンジンとして様々な論文で見かけるようになりました。そこで、GRRMがxTBを使うように連携させて反応経路探索をやってみたところ、一晩で1万個を超える分子構造を探索することができました。以下では、その構築/実行方法と結果を書いています。 環境構築 今回は AlmaLinux 9.6 に GRRM23 がインストールされている計算機を使いました。 xTB のインストール まずxTB 自体を計算機にインストールします。xTB のLinux用コンパイル済バイナ...
HPC

GRRM と UMA で反応経路探索してみた

UMAとは Meta社のUMA(Universal Model for Atoms)は、Meta社のFAIR(Fundamental AI Research)チームが開発した、分子や材料の化学特性を原子レベルで予測するための汎用AIモデルです。UMA には次の特徴があります。 汎用性:薬剤開発、電池材料、触媒研究など、幅広い分野に対応します。 高速性:従来の分子シミュレーションが数日かかっていたのに対し、UMAでは数秒で完了可能です。 高精度:従来の専用モデルと同等以上の予測精度を持ちます。 UMAは、Metaが公開した大規模な量子化学データセット「Open Molecule 202...
計算化学

GRRM20 with Matlantis のPoCを受け付けています!

8/21開催の弊社ワークショップ に聴講をお申込みいただいたお客様の中には、「GRRM20 with Matlantis でどんなことが出来るんだろう?」「性能がどの程度なんだろう?」などとGRRM20 with Matlantisが気になってお申込みになられた方もいらっしゃるかもしれません。 そのような方に朗報です! GRRM20 with Matlantis を実際に使って検証を行える有償PoC(Proof of Concept ; 概念検証)を受け付けています! 1か月と3か月のPoCプランをご用意しております。PoC用途の期間限定のGRRM20 with Matlantisを購入...
計算化学

GRRM20 with Matlantis の適用事例を掲載しました!

HPCシステムズ株式会社、Matlantis株式会社およびENEOS株式会社が共同開発したGRRM20 with Matlantis。GRRM20 with Matlantisは、Matlantis™上でGRRMを用いることにより、革新的な計算速度で化学反応経路の自動探索を実現します。 この度、ENEOS株式会社から提供された適用事例をWebページにて公開いたしました。 GRRM20 with Matlantisの有用性を示す結果が得られておりますので、是非ご覧ください!
計算化学

GRRMチュートリアル2023の参加者を募集しています

最新バージョン23をご好評いただいておりますGRRMについて、基本的な理論や使い方を修得することができるGRRMチュートリアルが今年も量子化学探索研究所主催で開催されます。久しぶりの現地開催となります。GRRMを使ってみたいので、基本的な使い方を学び、アドバンスドな内容にも触れてみたい、といった方に強くお勧めいたします! 開催概要やお申込みにつきましては以下をご参照ください。 GRRMチュートリアル2023 2023年度のGRRMチュートリアルが下記の要領で開催されます。  日時:11月24日(金)10:00-16:30  (受付開始: 9:30)  主催:NPO法人量子化学探索研究...
HPC

「富岳」でのアプリビルド検証状況

理化学研究所と進めさせていただいている「富岳」のクラウド的利用共同研究プロジェクトの中で、弊社でセットアップ実績のあるアプリケーションの「富岳」でのビルドに取り組んできました。 性能も電力対性能も世界一の「富岳」を使ってみたい、でもA64FX(aarch64)でいつも使っているアプリケーションが問題無く動くのかわからない、という不安もおありなのではと思いますので、生の事実を共有いたします。 量子化学 - Gaussian16 弊社では2020年7月からGaussian社と一緒に報告・検証を進めてきました。紆余曲折ありましたが、今年2月中旬に入手したGaussian社公式バイナリを用い...