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K4
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創薬支援ソフトウェア
K4は神戸医療産業都市推進機構が開発した創薬支援ソフトウェアです。...
https://www.hpc.co.jp/pdf/K4_191021.pdf
Amber
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生体分子系のシミュレーションのための
プログラム群
Amberは米カリフォルニア大学のP. A. Kollmanらのグループにより開発された、生体分子の分子動力学(MD)計算のための力場群であり、またこれらの...
https://ambermd.org/
Solution plus for AMBER
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分子動力学ソフトウェアで有名なAMBERに
誰もが簡単に使えるよう機能をプラス
分子動力学ソフトウェアで有名なAMBER に誰もが簡単に使えるよう機能をプラス!
シミュレーションが手軽にできるようになります。...
Gromacs
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地球最速のオープンソース
分子動力学計算プログラム
GROMACSはオランダ・フローニンゲン大学で開発された分子動力学(MD)計算プログラムです。地球上で最速のMD計算プログラムを目指しており、MPIあるいは...
Solution plus for GROMACS
詳細を見る
Solution plus for GROMACS
分子動力学ソフトウェアで有名なGROMACS に誰もが簡単に使えるよう機能をプラス!
シミュレーションが手軽にできるようになります。...
LAMMPS
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古典分子動力学計算の
オープンソース分子動力学計算プログラム
LAMMPSは米エネルギー省サンディア国立研究所のS. Plimptonらのグループにより開発された古典分子動力学計算プログラムです。金属や半導体などの固体...
https://lammps.sandia.gov/
VMD
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NAMDなどの生物学的システム計算向け
プリポストプログラム
VMDは米イリノイ大学アーバナ・シャンペーン校のTheoretical and Computational Biophysics Group (TCB)とP...
CPMD
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Car-Parinello 法による
非経験的分子動力学計算プログラム
CPMDは、CPMDコンソーシアムにより開発・管理されている、密度汎関数理論(DFT)をもとに平面波・擬ポテンシャル法、Car-Parinello法(CP法...
https://www.cpmd.org/
SYBYL®-X Suite
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米Certara社が開発した
創薬研究のための分子モデリング環境
米Certara社が開発した分子モデリングソフトウェアです。欧米・日本国内の製薬関連企業・大学などで広く利用されています。低分子から生体高分子まで広範囲の分...
https://www.g6g-softwaredirectory.com/bio/proteomics/structure-modeling/20710-Tripos-SYBYL-X-Suite.php
DL_POLY
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汎用古典分子動力学シミュレーションプログラム
DL_POLYは英国科学技術施設会議(STFC)デアズベリー研究所のI. T. TodorovとW. Smithらによって開発された汎用古典分子動力学(MD...
https://www.scd.stfc.ac.uk/Pages/DL_POLY.aspx
NAMD
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生体高分子のシミュレーションに威力を発揮する
無償の分子動力学計算プログラム
NAMDは米イリノイ大学アーバナ・シャンペーン校のTheoretical and Computational Biophysics Group (TCB)と...
https://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/
AmberTools
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生体分子のために開発された、 モデリング・分子動力学シミュレーションAmberに必要なツール
世界中で用いられている生体分子シミュレーションソフトウェアであるAmberをビルド・実行をするために必要な関連ツール群です。無料(ライセンス: GPL、一部...
https://ambermd.org/AmberTools.php
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