計算化学 ソフトウェア

• 概要
• 使い方
• 価格・仕様・保守
• GRRM23

主機能一覧

• ▸ 分子のカタログ表示・検索
• ▸ 反応経路の一覧表示
• ▸ 反応経路ネットワークの表示・解析
• ▸ エネルギーダイアグラムの表示
• ▸ EQ・PTの分子構造の一覧表示
• ▸ 反応経路の表示

基本的な使い方

1. GRRM 実行

サーバー計算機上でGRRMを実行すると、計算結果ファイル群(*.log や *.rrm)が出力されます。

2. GRRMmap 実行

サーバー計算機上でGRRMmapのコマンドを実行します。コマンドの引数として対象インプットのタイトル(GRRMインプットファイル名から.comを取り除いた文字列)を指定します。GRRMmap はGRRM計算結果ファイル群を解析し、Webブラウザで閲覧しやすい形式に整形して出力します。出力ファイルは転送しやすいように MAPDATA.zip ファイルとして保存されます。

3. MAPDATA.zip ファイル転送

サーバー計算機からお手元のPC上へ MAPDATA.zip ファイルを転送します（WinSCP等）。もしサーバー計算機上のWebブラウザで閲覧する場合は、この作業は不要です。

4. MAPDATA.zip ファイル解凍

PC上で MAPDATA.zip ファイルを展開します。

5. Webブラウザで閲覧

MAPDATA.zip ファイル内のHTMLファイルを Google Chrome 等のWebブラウザで開きます。見やすく可視化されたGRRM計算結果を解析しましょう。

価格

GRRMmapは3か月限定で無償利用いただけるβ版がございます。β版は1回のみ利用申請ができます。β版の搭載機能は正規版と変わりませんが、ご利用中に直面した動作不良についてご報告をお願いすることがございます。また、見つかった動作不良をすぐに改善することが難しいことがございます、あらかじめご了承お願い致します。

β版および正規版につきましては こちらのフォームからお問い合わせください。お問い合わせの際は、フリーメールアドレスではなく、ご所属の組織のメールアドレスをご記入ください。

ご利用までのながれ

0. GRRMmap のインストール先となる計算機のご検討

上記の 基本的な使い方 を参考に、GRRMmapのインストール先となる計算機をご検討ください。
GRRMmap が GRRM の出力ファイルを整形して、その結果をお手元のPCへ転送することを考えますと、クラスタ計算機の場合にはログインノード（もしくはヘッドノード）にGRRMmapをインストールすることが適当である場合が多いでしょう（計算ノード/クライアントノードに対してGRRMmapをインストールする必要は通常ないでしょう）。GRRMmapは複数のユーザーでご利用いただけますので、/usr/local の下など、複数ユーザーがアクセスできるフォルダへインストールすると運用管理しやすいでしょう。

1. お問い合わせ

GRRMmapのインストール先となる計算機が決まりましたら、こちらのフォームからお問い合わせください。弊社営業担当が折り返しご連絡いたします。

2. ソフトウェア使用許諾契約の締結

GRRMmapの使用許諾契約書にご署名いただきます。利用期間についてもご相談ください。

3. ご発注～納品

ご発注後、通常 3営業日 で納品物をメールでご連絡いたします。

5. インストール

GRRMmapのユーザーマニュアルに沿ってGRRMmapをインストールしてご利用ください。

仕様

GRRMmap は Singularityコンテナ の形式で配布いたします。そのため幅広いLinux系OSで動作いたしますが、あらかじめOS上にSingularityコンテナのランタイム（=動作環境）がインストールされている必要があります。なお、弊社製造のHPC・AI製品のLinux系OSには、出荷時に SingularityCE または Apptainer のいずれかが標準でインストール済みとなっていますので、スムーズに起動いただけます。

動作環境（計算サーバー側）	- ハードウェア - 下記が動作する x86_64 計算機 - 必須コンテナランタイム - Singularity Enterprise または SingularityPRO または SingularityCE または Apptainer ※1 - 必須ソフトウェア - GRRM17 または GRRM20 または GRRM23 ※2
動作環境（PC側）	- 推奨ブラウザ - Google Chrome
納品物	GRRMmapパッケージ、GRRMmap用STLibパッケージ、GRRMmapユーザーマニュアル（日本語版、英語版）

※1 本製品に含まれておりませんので予め御用意ください。
※2 本製品に含まれておりませんので予め御用意ください。GRRM23 についてはこちらをご覧ください。

保守

GRRMmapの動作や操作についてのお問い合わせはGRRMmapのユーザーマニュアル中に記載していますお問い合わせ先へお送りください。ユーザーマニュアルには、各機能の操作説明に加えて、よくある質問とその答えを記載しておりますので、お問い合わせ前に是非ご一読下さい。

登録商標

GRRMは量子化学探索研究所の登録商標です。
GRRM is a registered trademark of Institute for Quantum Chemical Exploration .