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Software

計算化学ソフトウェア

OVITO

OVITO（Open Visualization Tool）は、Alexander Stukowski博士によって開発された、主に分子動力学（MD）シミュレーションや、原子・粒子レベルのシミュレーション結果の可視化・解析に用いられる科学用ソフトウェアです。
オープンソース版のOVITO Basicおよびプロフェッショナル版のOVITO Proがあり、OVITO Proで追加される分析・視覚化・自動化機能は、研究能力と生産性を大幅に向上させます。

公式サイト：https://www.ovito.org/
ユーザーマニュアル：https://www.ovito.org/docs/current/
Python リファレンス；https://www.ovito.org/docs/current/python/

主な機能

分析機能
- 幾何学的表面積計算、細孔・空洞解析
- ボロノイ解析、変位計算、ひずみ・変形場算出
- 原子構造分類
- 粒界セグメンテーション、転位解析（DXA）、欠陥同定などのミクロ組織解析
- 時系列解析、ヒストグラム、データプロット
可視化機能
- 球・楕円体・超楕円体・カスタム形状など多様なパーティクル表示
- 軌跡線、ベクトルグリフ、メッシュ・多面体ジオメトリ
- ボクセルグリッドデータ、等値面計算
- 周期境界条件および非直交シミュレーションドメインの完全サポート
レンダリング
- リアルタイムビューポートの可視化
- マルチビューポート、比較の可視化
- パストレーシングレンダリングエンジンによる高品質な科学イラスト・アニメーション作成
- 3DモデルをWeb・PowerPoint・Blender向けにエクスポート可能
Python連携
- 強力なPython APIを備え、解析・可視化タスクの自動化や再現性のあるワークフロー構築が可能

Pro版で追加される機能

追加の解析モディファイア
- 空間ビニング
- 時間平均・時系列解析
- 結合解析
- 体積領域解析
ファイル形式の追加サポート
- ASEデータベースやトラジェクトリ、glTF 3Dシーンのエクスポートに対応
高品質レンダリングエンジン
- Tachyon、OSPRay、VisRTXといった高性能なレンダリングエンジンを搭載
Pythonコード生成
- データや可視化パイプラインを、すぐに実行可能なPythonプログラムとしてエクスポート可能
カスタムモディファイア開発
- 独自のデータ解析アルゴリズムをPythonで記述
- オンラインリポジトリから作成済みのモディファイアをダウンロード
ユーザー定義のビューポートオーバーレイ
- レンダリングされた画像や動画に、データプロットなどの追加情報を重ねて表示
- Pythonで記述した独自のオーバーレイを利用可能
カスタムデータ形式のインポート
- 統合されたPythonインタープリタを使用し、新しいデータ形式用のファイルリーダーを開発可能
複数パイプライン
- 複数のシミュレーションデータを可視化シーンに追加し、比較解析が可能
- パイプラインの分岐機能を利用可能
リモートHPCアクセス
- OpenSSH統合によるリモートデータへの直接アクセス
- スマートカード・2要素認証（2FA）対応