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VASP

VASPはオーストリア・ウィーン大学で開発された、擬ポテンシャルと平面波基底を用いた非経験的 (ab initio) 量子分子動力学 (MD) 計算プログラムです。結晶や無機固体の周期的境界条件を用いた計算を行います。VASPに実装されている方法は有限温度局所密度近似 (LDA, 変分量として自由エネルギーを用いる) に基づき、効果的な行列対角化法とPulay混合を使用してMDステップごとに電子基底状態を精密に評価します。バンド計算、安定構造や遷移状態構造の最適化、拡散パスの検討、反応解析など様々な問題に適用されています。
弊社では、VASPの各バージョンのベンチマークライセンスを所有しております。ご利用ください。

STATUS

[2017/10/23]
ピックアップ情報:NVIDIA Tesla V100 による VASP 5.4.4 ベンチマーク結果を掲載しました。

[2013/12/09]
Wannier90 への対応が VASP5.2.12 より実装されました。弊社のビルド代行では最新の VASP5.3.3 で Wannier90用のタグ、LWANNIER90 に対応したバイナリが必要というお客様の要望にお答え可能です。(動作可能な Wannier90 のバージョンは 1.2 となります)

Wannier90( http://www.wannier.org/index.html )とは固体物理学の Wannier 関数を扱う電子構造計算アプリケーションです。Wannier 関数は、結晶格子の結合に局在する電子軌道を示すものです。Wannier90 はGPLで提供されており、多くのアプリケーション、代表的にはPWscfやsiesta、WIEN2kなどで結果を利用したり、インターフェースから利用されたりしています。VASPでのWannier90の使い方についてはこちらをご参照ください。

[2012/11/26]
VASP ユーザーマニュアルの配布を開始しました。

[2012/10/24]
VMDでVASPの計算結果を可視化する手順をご紹介いたします。

[2012/10/16]
2012年9月27日にVersion 5.3.2がリリースされました。現在検証を行っています。弊社は5.2系でシステム構築実績が豊富にあります。

[2012/03/07]
新世代CPU インテル®Xeon®プロセッサーE5-2600シリーズにてAVXを適用したベンチマークの結果をご報告します。詳細はこちらをご参照ください。また、多数VASPジョブの同時実行性能についてはこちらをご参照ください。

[2011/04/27]
VASPのAVX適用可能性について、興味深い結果が出ましたのでご報告します。詳細はこちらをご参照ください。

[2010/12/03]
4.6系はシステム構築実績多数です。5.2系はシステム構築可能になりました。最新版は5.2.11(のバグフィクス版)です。

特記事項1

VASP 5.2がリリースされ、新しいVASPでガンガン計算している方も多数いらっしゃる亊と思います。こうしたVASPのヘビーユーザーには、なにを今さら、といった内容なのですが初心者向けに簡単なTipsをこちらに掲載しました。

特記事項2

Ver10.0 以降のIntelCompilerを使用する場合、CompilerOptionに非常に繊細です。特長として、ネットワークがボトルネックになりやすい傾向があります。5.2.2も同じ傾向です。配付ソースの5.2.2のmakefileでは、gamma only mpiバージョンはic10.1では、コンパイル出来なかったという表記がありますが、この問題は回避策があります。VASP 5.2.2をEL5系でビルドする場合、mkl9.1を使うと問題があります。mkl 9.1の落し穴をご覧下さい。

特記事項3

vaspの可視化ツール

VASPはテキスト形式で入力用データファイルを作成し、計算結果もテキスト形式で出力されます。VASPのユーザーはこうした形式に慣れているのですが、VASPをこれから始めるというい場合など、VASPの計算結果を可視化したい場合、簡単なツールはないかと質問される場合があります。VASPのホームページには、幾つか可視化ソフトとして紹介されていますがGPLのものもあります。

p4vasp(http://www.p4vasp.at/

vaspの結果などをビジュアライズするツールです。多機能で必要十分かもしれません。2011年6月現在、最新は0.3.20です。

vaspview(http://vaspview.sourceforge.net/

VASP data viewerです。但し、INCARなどを可視化する訳ではありません。elfcarなどの可視化が中心です。

この2つVASPの可視化ソフト(p4vasp 0.3.13 , vaspview 1.05)は RPM packageにして、ソースコードとともに5.5系のOSをインストールする際に同梱しています。

VASP検証日記

 HPCシステムズは、VASPの各バージョンのベンチマークライセンスを所有しております。ご利用ください。
 ベンチマークテスト、計算機システム構築サービス、ライセンスをお取扱いしています。

VASP ベンチマーク bench.Hg(水銀)
System# node# CPU# CoreMessage
Passing
Device
Time
elapsed
(sec)
VASP Ver.CompilerMath Library
Xeon W5590 3.33GHz/8MB(L3) 1 2 8 SMP 11 4.6.36 ifc10.1 MKL10.1.3
Xeon W5590 3.33GHz/8MB(L3) 1 2 8 SMP 13 5.2.2 ifc10.1 MKL10.1.3
Xeon W5590 3.33GHz/8MB(L3) 1 2 4 SMP 16 4.6.36 ifc10.1 MKL10.1.3
Xeon W5590 3.33GHz/8MB(L3) 1 2 4 SMP 16 5.2.2 ifc10.1 MKL10.1.3
Xeon E3110 3.00GHz/6MB(L2) 4 4 8 GbE 20 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Xeon E5472 3.00GHz/6MBx2(L2) 1 2 8 SMP 21 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Xeon E5472 3.00GHz/6MBx2(L2) 1 2 4 SMP 24 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Itanium 2 1.4GHz/3MB(L3) 8 16 16 Myrinet 24 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Xeon X7350 2.93GHz/8MB(L2) 1 4 8 SMP 26 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Xeon X7350 2.93GHz/8MB(L2) 1 8 16 SMP 26 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Xeon X5272 3.40GHz/6MB(L2) 1 2 4 SMP 27 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Core2Duo 2.66GHz/4MB(L2) FSB1066 4 4 8 GbE 27 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.1
Xeon E3110 3.00GHz/6MB(L2) 2 2 4 GbE 28 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Core2 Duo E6850 3.0GHz/4MB(L2) 2 2 4 Infiniband/
OpenMPI
28 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Core2 Extreme QX9650 3.00GHz/6MBx2(L2) 1 1 4 SMP 29 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Xeon W5590 3.33GHz/8MB(L3) 1 2 2 SMP 29 4.6.36 ifc10.1 MKL10.1.3
Xeon W5590 3.33GHz/8MB(L3) 1 2 2 SMP 30 5.2.2 ifc10.1 MKL10.1.3
Itanium2 9050 1.6GHz/2x12M DDR2 533 1 4 8 SMP 30 4.2.26 ifc9.1 MKL8.1
Xeon X7350 2.93GHz/8MB(L2) 1 4 4 SMP 32 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Xeon 5160 3.0GHz 5000X 1 2 4 SMP 33 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Pentium XE 955 3.46GHz/4MB(L2) FSB1066 4 4 8 GbE 33 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Xeon 5160 3.0GHz/4MB(L2) 5000P 1 2 4 SMP 34 4.6.28 ifc 9.1 MKL8.0
Itanium 2 1.4GHz/3MB(L3) 4 8 8 Myrinet 34 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Core2 Duo E6850 3.0GHz/4MB(L2) 2 2 4 GbE 35 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Xeon 5150 2.66GHz/4MB(L2) 1 2 4 SMP 37 4.6.28 ifc 9.1 MKL8.0
Xeon 5150 2.66GHz/4MB(L2) 1 2 4 SMP 37 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Xeon X5272 3.40GHz/6MB(L2) 1 2 2 SMP 38 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Pentium D 840 3.2GHz/2MB(L2) FSB800 4 4 8 GbE 39 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.2
Itanium2 9050 1.6GHz/2x12M DDR2 533 1 4 4 SMP 39 4.2.26 ifc9.1 MKL8.1
Core2Duo 2.66GHz/4MB(L2) FSB1066 2 2 4 GbE 40 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Xeon E5472 3.00GHz/6MBx2(L2) 1 2 2 SMP 41 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Itanium2 9050 1.6GHz/2x12M DDR 266 1 4 8 SMP 42 4.2.26 ifc9.1 MKL8.1
Xeon E3110 3.00GHz/6MB(L2) 1 1 2 SMP 44 4.2.28 ifc9.1 MKL9.1
Itanium2 9050 1.6GHz/2x12M DDR 266 1 4 4 SMP 45 4.2.26 ifc9.1 MKL8.1
Pentium XE 955 3.46GHz/4MB(L2) FSB1066 2 2 4 GbE 47 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Xeon 3.6GHz/2MB(L2) E7520 FSB800 2 4 4 GbE 47 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.1
Xeon W5590 3.33GHz/8MB(L3) 1 1 1 - 47 4.6.36 ifc10.1 MKL10.1.3
Core2 Duo E6850 3.0GHz/4MB(L2) 1 1 2 SMP 48 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Xeon 5160 3.0GHz 5000X 1 1 2 SMP 48 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.1
Xeon 5160 3.0GHz/4MB(L2) 1 1 2 SMP 49 4.6.28 ifc 9.1 MKL8.0
Opteron 880 2.4GHz/1MB(L2)/core FSB800 1 2 4 SMP 49 4.6.28 ifc 9.0 MKL7.2
Itanium2 1.6GHz/9MB(L3) DDRI-200 1 4 4 SMP 51 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.1
Xeon W5590 3.33GHz/8MB(L3) 1 1 1 - 51 5.2.2 ifc10.1 MKL10.1.3
Xeon X7350 2.93GHz/8MB(L2) 1 2 2 SMP 52 4.6.28 ifc 9.1 MKL9.1
Itanium 2 1.4GHz/3MB(L3) 2 4 4 Myrinet 53 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Xeon 5150 2.66GHz/4MB(L2) 1 1 2 SMP 54 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Itanium2 1.6GHz/9MB(L3) DDRI-200 1 4 4 SMP 55 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.1
Pentium D 840 3.2GHz/2MB(L2) FSB800 2 2 4 GbE 55 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Pentium D 840 3.2GHz/2MB(L2) FSB800 2 2 4 GbE 57 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.2
Core2Duo 2.66GHz/4MB(L2) FSB1066 1 1 2 GbE 58 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.1
Xeon 5150 2.66GHz/4MB(L2) 1 1 2 SMP 61 4.6.28 ifc 9.1 MKL8.0
Pentium XE 965 3.73GHz/4MB(L2) 1 1 2 SMP 65 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Xeon X5272 3.40GHz/6MB(L2) 1 1 1 - 67 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Xeon E3110 3.00GHz/6MB(L2) 1 1 1 - 67 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Pentium XE 955 3.46GHz/4MB(L2) 1 1 2 SMP 68 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Pentium D 950 3.4GHz/4MB(L2) 1 1 2 SMP 68 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Itanium2 9050 1.6GHz/2x12M DDR2 533 1 4 2 SMP 68 4.2.26 ifc9.1 MKL8.1
Core2 Duo E6850 3.0GHz/4MB(L2) 1 1 1 - 71 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Xeon E5472 3.00GHz/6MBx2(L2) 1 1 1 - 72 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Itanium2 9050 1.6GHz/2x12M DDR 266 1 4 2 SMP 76 4.2.26 ifc9.1 MKL8.1
Xeon 3.6GHz/2MB(L2) E7520 FSB800 1 2 2 SMP 77 ifc 8.1 MKL7.1
Itanium2 1.6GHz/9MB(L3) DDRI-200 1 2 2 SMP 79 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.1
Xeon 5160 3.0GHz/4MB(L2) 1 1 1 - 83 4.6.28 ifc 9.1 MKL8.0
Itanium2 1.6GHz/6MB(L3) DDRI-200 1 2 2 SMP 83 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.1
Pentium D 840 3.2GHz/2MB(L2) FSB800 1 1 2 SMP 84 4.6.26 ifc 9.0 MKL7.2
Opteron 880 2.4GHz/1MB(L2)/core FSB800 1 1 2 SMP 84 4.6.28 ifc 9.0 MKL7.2
Core2Duo 2.66GHz/4MB(L2) FSB1066 1 1 1 SMP 86 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.1
Xeon X7350 2.93GHz/8MB(L2) 1 1 1 SMP 88 4.6.28 ifc9.1 MKL9.1
Pentium D 840 3.2GHz/2MB(L2) FSB800 1 1 2 SMP 88 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.2
Xeon 5160 3.0GHz 5000X 1 1 1 SMP 90 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.1
Alpha EV67 833MHz/16MB(L2) ES40 4 4 SMP 91 COMPAQ
Fortran
CXML
Xeon 5150 2.66GHz/4MB(L2) 1 1 1 - 92 4.6.28 ifc 9.1 MKL8.0
Itanium 2 1.4GHz/3MB(L3) 1 2 2 SMP 93 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Xeon 5150 2.66GHz/4MB(L2) 1 1 1 - 94 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Opteron 2.4GHz/1MB(L2) FSB800 DDR400 1 2 2 SMP 109 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.2
Xeon 5140 2.33GHz/4MB(L2) 1 1 1 - 110 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Pentium XE 965 3.73GHz/4MB(L2) 1 1 1 - 111 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Pentium XE 955 3.46GHz/4MB(L2) 1 1 1 - 118 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Itanium2 9050 1.6GHz/2x12M DDR2 533 1 4 1 SMP 119 4.2.26 ifc9.1 MKL8.1
Pentium D 950 3.4GHz/4MB(L2) 1 1 1 - 120 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Pentium D 960 3.6GHz/4MB(L2) 1 1 1 - 121 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Xeon 3.6GHz/2MB(L2) E7520 FSB800 1 1 1 - 127 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.1
Itanium2 9050 1.6GHz/2x12M DDR 266 1 4 1 SMP 134 4.2.26 ifc9.1 MKL8.1
Itanium2 1.6GHz/9MB(L3) DDRI-200 1 1 1 - 135 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.1
Pentium D 840 3.2GHz/2MB(L2) FSB800 1 1 1 - 139 4.6.26 ifc 9.0 MKL7.2
Itanium2 1.6GHz/6MB(L3) DDRI-200 1 1 1 - 141 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.1
Pentium D 840 3.2GHz/2MB(L2) FSB800 1 1 1 - 143 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.2
Opteron 880 2.4GHz/1MB(L2)/core FSB800 1 1 1 - 153 4.6.28 ifc 9.0 MKL7.2
Pentium4 X.E. 3.2GHz/2MB(L3) 1 1 1 - 160 4.5.x HPCS
Build
Itanium 2 1.4GHz/3MB(L3) 1 1 1 - 164 4.6.28 ifc 9.0 MKL8.0
Itanium2 1.4GHz/3MB(L3) 1 1 1 - 164
Itanium2 1.6GHz/3MB(L3) 1 1 1 - 166 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.1
Opteron 2.4GHz/1MB(L2) FSB800 1 1 1 - 198 4.6.26 ifc 8.1 MKL7.2

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