cubman
cubmanプログラムはGaussianによって生成された電子密度や静電ポテンシャルの値の入ったcubeを操作します。このプログラムでは実行する操作をユーザーが指示し，その後必要なファイル名を指定します。実行可能な操作と，それに対応するサブコマンドは以下の通りです：
add 新しいcubeを生成するために２つのcubeを加えます
copy cubeをコピーします。可能なら，フォーマット形式から非フォーマット形式（またはその逆）に変換します。
diff ２つのcube間の差のプロパティを，新しいcubeを作成せずに計算します。
prop あるcubeのプロパティを計算します。
subtract 2つのcubeの差をとって新しいcubeを生成します。
scale cubeを定数倍して，新しいcubeを生成します。
サブコマンドは，短縮する（コマンド名を最短で表記する）こともできます。
以下は， cubmanの実行例（注釈つき）です。なお，ユーザーが入力している部分は太字(Bold)で，また出力は一部省略してあります。
$ cubman Action [Add, Copy, Difference, Properties, SUbtract, SCale]? p Input file? b.cube Is it formatted [no,yes,old]? y Opened special file b.cube. Input file titles: First excited state of propellane ジョブのタイトル行 CI Total Density cubeファイルの内容 SumAP= 13.39263 SumAN= .00000 SumA= 13.39263 cube内容の統計 CAMax= 3.35320 XYZ= .18898 -1.32280 .000004 CAMin= .00000 XYZ= -9999.00000 -9999.00000 -9999.00000 DipAE= -.8245357658 .7624198057 .1127178115 DipAN= -.0000060000 -.0000060000 .0000000000 DipA= -.8245417658 .7624138057 .1127178115 $ cubman Action [Add, Copy, Difference, Properties, SUbtract, SCale]? su First input? b.cube Is it formatted [no,yes,old]? y Opened special file b.cube. Second input? a.cube Is it formatted [no,yes,old]? y Opened special file a.cube. Output file? c.cube 新規cubeファイル名 Should it be formatted [no,yes,old]? y Opened special file c.cube. Input file titles: First excited state of propellane １番目のcubeファイルのタイトル CI Total Density １番目のcubeファイルの内容 Input file titles: Propellane HF/6-31G* ２番目のcubeファイルのタイトル SCF Total Density ２番目のcubeファイルの内容 Output file titles: 新しいファイルに使われる合成されたタイトル First excited state of propellane || Propellane HF/6-31G* CI Total Density - SCF Total Density 計算した差分 SumAP= 13.39263 SumAN= .00000 SumA= 13.39263 １番目のcubeの統計 CAMax= 3.35320 XYZ= .18898 -1.32280 .000004 CAMin= .00000 XYZ= -9999.00000 -9999.00000 -9999.00000 SumBP= 13.38168 SumBN= .00000 SumB= 13.38168 ２番目のcubeの統計 CBMax= 3.39683 CBMin= .00000 SumOP= .63453 SumON=-.62358 SumO= .01094 出力cubeの統計 COMax= .49089 COMin=-.39885 DipAE= -.8245357658 .7624198057 .1127178115 DipAN= -.0000060000 -.0000060000 .0000000000 DipA= -.8245417658 .7624138057 .1127178115 DipBE= -.8306292172 .5490287046 .1243830393 DipBN= -.0000060000 -.0000060000 .0000000000 DipB= -.8306352172 .5490227046 .1243830393 DipOE= .0060934514 .2133911011 -.0116652278 DipON= -.0000060000 -.0000060000 .0000000000 DipO= .0060874514 .2133851011 -.0116652278
この出力では，入力cubeはAおよびB, 出力cubeはOで表されます。その他の文字では，Nは（内容により）「負の値(negative value)」または「核(nuclear)」を表し，Pは「正の値(positive value)」を，Eは「電気的(electronic)」，Cは「電荷(charge)」，Dip は「双極子(dipole)」，Sumは「合計(sum)」，Maxは「最大(maximun)」， Minは「最小(minimum)」を表します。したがって，SumANは１番目の入力cubeに対する合計を負の値に対して取ったことを示し，DipON は出力cubeに対する双極子モーメントの核寄与を示します。同様に，CBMaxは２番目のcubeに対する最大の電荷を，SumOは出力cubeでの値の合計（正，負の値両方）を示します。