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PAICS Parallelized ab-initio calculation system based on FMO
岐阜大学人獣感染防御研究センター石川岳志助教によりフルスクラッチから開発された、FMO法
によりタンパク質など生体巨大分子系の量子化学計算を実現するプログラムです。
創薬研究のための実用的な量子化学計算プログラムとして大きく期待されています。
フラグメント分子軌道(FMO)プログラムPAICS
■PAICSの機能
FMO法に基づく量子化学計算プログラム
計算手法はRHF、MP2、局在化MP2、RI-MP2を実装
入力ファイル作成支援プログラムPaics View付属
■PAICSの特長
生体分子を量子化学的に取り扱うことが可能
タンパク質－リガンド間の相互作用の情報を高速に得ることができる
■創薬研究への適用
量子化学計算を利用して次世代創薬への扉を開く
リガンド-タンパク質間の相互作用の詳細な解析
タンパク質内の相互作用の解析
PAICS/PaicsViewユーザマニュアル(チュートリアル付属)
量子化学計算の創薬研究への適用
プリオンタンパク質-GN8複合体
GN8近傍アミノ酸残基のIFIE解析例 GN8の各フラグメントと プリオンタンパク質間のIFIE解析例
PAICSを適用した研究論文リスト
Teoretical study of the prion protein based on the fragment molecular orbital method,
T. Ishikawa, T. Ishikura, and K. Kuwata, J. Comput. Chem.,30 (2009) 2594-2601
Fragment molecular orbital calculation using the RI-MP2 method,
T.Ishikawa and K. Kuwata, Chem. Phys. Lett., 474 (2009) 195-198
Interaction analysis of the native structure of prion protein with quantum chemical calculations,
T. Ishikawa and K. Kuwata, J. Chem. Theor.Comput., 6 (2010) 538-547
Acceleration of monomer self-consistent charge process in fragment molecular orbital method,
T. Ishikawa and K. Kuwata, C.B.I.J., 10 (2010) 24-31
PAICS/PaicsViewの知的財産権は岐阜大学のものです