Software
計算化学 ソフトウェア
LAMMPS
LAMMPSは米エネルギー省サンディア国立研究所のS. Plimptonらのグループにより開発された古典分子動力学(MD)計算プログラムです。金属や半導体などの固体、生体分子やポリマーなどのソフトマター、メゾスコピック系物質などに対応した多彩なポテンシャルが用意されています。開発当初はFortranでコーディングされていましたが、現在は、C++でコーディングされています。並列処理やGPU、Xeon Phiを利用して容易に高速化が可能です。フリーソフトウェアであり、GNU GPLライセンスに基づいて自由に改変可能であることも特徴です。
HPCシステムズのビルドについて
Status
https://lammps.sandia.gov/bug.html
18 Sep 2018
Laurent Joly (University of Lyon) and Romain Vermorel (University of Pau and Pays de l’Adour): New compute stress/mop and compute stress/mop/profile commands. See PR #1092.
New compute chunk/spread/atom and compute reduce/chunk commands. See PR #1089.
Variable option for compute bond/angle/dihedral local commands. See PR #1089.
This patch file can be applied to the 5 Sep 2018 version. This is the list of changed files.
マニュアル
https://lammps.sandia.gov/index.html
特記事項
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