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Gaussianジョブのルートセクションは，シャープ記号(#)で始めます（行頭に空白は必要ありません）。残りのルートセクションはフリーフォーマットで指定できます。ほとんどのジョブでは，計算に関するすべての情報をこの第一行に記述します。また，1行で書かずに，何行かに渡って続けることも許されています（それらの行は#記号で始める必要はありません）。ルートセクションの最後に空行を入れることにより，ルートセクションの終わりを示します。

ルートセクションにキーワードを指定しなかった場合には，デフォルトのHF/STO-3G SPになります。

選択形式

#N
標準レベルで出力を行います。デフォルトです。

#P
詳細な出力を行います。各リンクの開始時と終了時における多種多様なマシン依存情報（実行時間など）や，SCFの収束に関する情報が出力されます。

#T
簡潔な出力となります。重要な情報と結果しか出力しません。