力場最適化ソフトウェア
Simple Fit (仮称)

分子動力学計算(MD)の精度の要は力場パラメータ。しかし、力場パラメータの作成は極めて大変なため、力場パラメータの自作はあきらめ、論文から力場パラメータを探して代用することが多々ありました。

Simple Fitは量子化学計算による計算値を可能な限り再現するよう力場パラメータを自動的に最適化します。



計算例

ロキソプロフェン分子の力場パラメータ最適化


仕様

製品名Simple Fit (仮称)
力場関数系AMBER力場、CHARMM力場、OPLS力場など
最適化可能パラメータ分子内力場のみ
インプットトポロジー、トラジェクトリ、Runインプット
アウトプット最適化されたトポロジー
動作環境
(OS)
Red Hat Enterprise Linux 6.x または CentOS 6.x
動作環境
(ソフトウェア)
GROMACS 4.6.3
Gaussian09 または AmberTools14/15/16
価格・発売時期未定

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